89% sveže čebule predstavlja voda. V vsebnosti hranil in polifenolov obstajajo velike razlike med sortami čebule, pri čemer ima rjava čebula najvišjo vsebnost flavonoidov, rdeča pa antocianinov. Najvišjo vsebnost vitamina C ima rdeča čebula, medtem, ko pri ostali dveh čebulah prednjačita piridoksin (vitamin B6) in biotin (vitamin B7). Vsebnost hranil je višja v središču čebulice in se zmanjšuje od znotraj navzven.